এরপর তিনি ১৯৯ হিজরি সনে মিশরে প্রবেশ করেন এবং সেখানে মৃত্যু পর্যন্ত অবস্থান করেন; তিনি মানুষকে সুন্নাহ, সুন্নাহর ফিকহ এবং কিতাব শিক্ষা দিতেন এবং তাঁর বিরোধীদের সাথে বিতর্ক ও যুক্তি-তর্ক করতেন। তাদের অধিকাংশ ছিল তাঁর শিক্ষক মালিক ইবনে আনাসের অনুসারী এবং তারা তাঁর মাজহাবের প্রতি অত্যন্ত গোঁড়া ছিল। অতঃপর শাফিঈ তাঁর জ্ঞান, আদর্শ ও প্রজ্ঞা দিয়ে তাদের অভিভূত করেন; তারা এমন একজন ব্যক্তিকে দেখতে পেলেন যার সদৃশ চোখ ইতিপূর্বে কখনো দেখেনি, ফলে তারা তাঁর মজলিসে নিয়মিত উপস্থিত হতে শুরু করল। তারা তাঁর নিকট থেকে কিতাব ও হাদিসের জ্ঞান লাভ করত এবং তাঁর নিকট থেকে ভাষা, বংশবিদ্যা ও কবিতা গ্রহণ করত। তিনি তাঁর সময়ের কিছু অংশে তাদের চিকিৎসাশাস্ত্রের জ্ঞানও প্রদান করতেন। অতঃপর তারা তাঁর নিকট থেকে বিতর্ক ও আলোচনার আদব বা শিষ্টাচার শিক্ষা লাভ করত। তিনি নিজ হাতে কিতাবসমূহ রচনা করতেন, অতঃপর তারা তাঁর নিকট সেই কিতাবগুলোর প্রতিলিপি পড়ে শোনাতেন অথবা তিনি তাদের কিছু অংশ শ্রুতিলিখনের মাধ্যমে লেখাতেন। এর ফলে তাদের অধিকাংশ সেই গোঁড়ামি থেকে ফিরে আসল যা তারা পোষণ করত এবং তারা তাঁর নিকট থেকে ইজতিহাদ ও তাকলিদ বর্জন করা শিক্ষা করল। এভাবে শাফিঈ পৃথিবীর দিগন্তসমূহকে ইলম দ্বারা পূর্ণ করে দিলেন।
তিনি মিশরে ইন্তেকাল করেন এবং সেখানেই সমাহিত হন। তাঁর কবর বর্তমান সময় পর্যন্ত সুপরিচিত ও প্রসিদ্ধ। তিনি ৫৪ বছর জীবন লাভ করেছিলেন।
তিনি ১৫০ হিজরি সনে গাজায় জন্মগ্রহণ করেন এবং ২০৪ হিজরি সনের রজব মাসের শেষ দিন জুমার রাতে ইন্তেকাল করেন এবং জুমার দিন আসরের পর তাঁকে দাফন করা হয়। আল্লাহ তাঁর ওপর রহমত বর্ষণ করুন।