বিদ্রোহি দলের বিরুদ্ধে যুদ্ধের ব্যাপারে খারিজিরা বলেছে, আমরা তাদের কাফির হিসেবে গণ্য করে তাদের বিরুদ্ধে যুদ্ধ পরিচালনা করব। আর মুরজিআরা বলেছে, মুমিনদের মধ্যে কোনো যুদ্ধ নেই এবং অস্ত্রের মাধ্যমে কোনো প্রতিরোধ করা যাবে না, কারণ তারা আল্লাহর একত্ববাদের সাক্ষ্যদানকারী। মুতাজিলাগণ আত্মরক্ষামূলক যুদ্ধের আবশ্যকতা প্রকাশ করেছে, তবে আক্রমণ বা বন্দি করার উদ্দেশ্যে নয়। আল-জাহিজ বলেছেন, এটিই সর্বশ্রেষ্ঠ মত, সবচেয়ে ন্যায়সঙ্গত এবং আল্লাহর কাছে সবচেয়ে সন্তোষজনক। আল্লাহ বলেছেন: "অতএব আমার ওই বান্দাদের সুসংবাদ দাও, যারা মনোযোগ দিয়ে কথা শোনে এবং তার মধ্য থেকে যা উত্তম তা অনুসরণ করে।" (সূরা যুমার: ১৭-১৮)। তিনি বলেছেন, আমাদের নিকট মূলনীতি হলো এই যে, এমনকি আলীর (রা.) মতো সুউচ্চ গুণাবলিসম্পন্ন এবং অগ্রবর্তী কেউ নন, বরং তাঁর চেয়ে অনেক সাধারণ কোনো ব্যক্তির ক্ষেত্রেও এই ধারণা পোষণ করা বৈধ নয় যে তিনি হত্যায় জড়িত, যদিও মানুষ উসমানকে (রা.) হত্যার অভিযোগে তাঁকে কলঙ্কিত করেছে এবং দাবি করেছে যে তিনি তাঁর হন্তারকদের আশ্রয় দিয়েছেন ও তাদের রক্ষা করেছেন।
মানুষ স্বয়ং আল্লাহ এবং তাঁর গুণাবলি সম্পর্কে কঠোরতম মতভেদে লিপ্ত হয়েছে, সেখানে আলী ও উসমান (রা.) সম্পর্কে তো বলারই কিছু নেই। তবে কোনো কোনো আলিম বলেছেন, উসমানের (রা.) বিষয়টি যারা প্রত্যক্ষ করেছেন তারাই সেটি উপলব্ধি করতে অক্ষম ছিলেন, তাহলে যারা অনুপস্থিত ছিল তাদের পক্ষে তা কীভাবে সম্ভব? কারণ বিষয়টি অত্যন্ত জটিল ছিল। তিনি আরও বলেছেন, যদি মুআবিয়া—যিনি রক্তের বদলা নেওয়ার দাবিদার ছিলেন—উসমানের পরে হিজায ও ইরাকে শাসনভার গ্রহণ করতেন, তবে এমন লোক অবশ্যই পাওয়া যেত যারা বলত যে, এটি ছিল তাঁরই কোনো গোপন ষড়যন্ত্র এবং তিনিই তাঁর বিরুদ্ধে পরিস্থিতি বিশৃঙ্খল করেছেন। আপনি যদি এটি প্রকাশ্য ও ব্যাপকভাবে আলোচিত হতে না দেখেন, তবে তা অবশ্যই গোপনে বিদ্যমান ছিল। মানুষের প্রকৃতি শুরু থেকেই এমনই। আলীর (রা.) জন্য সবচেয়ে বড় পরীক্ষা ছিল উসমানের (রা.) রক্ত এবং এ বিষয়ে তাঁর প্রতি আনীত অভিযোগ। কারণ সাধারণ জনগণ তাঁর রক্তের মর্যাদা অত্যন্ত গুরুত্বের সাথে দেখত এবং কুরাইশ বংশ ব্যতীত বাকিরা আলীকে (রা.) এ থেকে নির্দোষ মনে করত। প্রকৃতপক্ষে কুরাইশরাই তাঁর ওপর হত্যার দায় চাপাত। আর তারাই ছিল খিলাফতের সৈন্যবাহিনী, সেনাপতি ও নেতাদের মধ্যে সংখ্যাগরিষ্ঠ। ফলে আলী (রা.) আশঙ্কা করেছিলেন যে, তিনি যদি হত্যাকারীদের থেকে সম্পর্কহীনতার প্রকাশ্য ঘোষণা দেন, তবে তাঁর সৈন্যরা তাঁর বিরুদ্ধে চলে যাবে এবং তাঁকে ছেড়ে অন্যের কাছে চলে যাবে। কারণ তাদের অধিকাংশের মনেই উসমানের (রা.) প্রতি ক্ষোভ ছিল। তাই তিনি এ বিষয়ে স্পষ্টভাবে কিছু বলা অপছন্দ করতেন এবং যথাসম্ভব উসমানের কথা উল্লেখ করা থেকে বিরত থাকতেন। যখন তিনি কথা বলতে বাধ্য হতেন, তখন এমন কথা বলতেন যা উভয় পক্ষের সন্তুষ্টির অবকাশ রাখে এবং তাঁর উক্তিকে এমনভাবে উপস্থাপিত করতেন যা বিভিন্নভাবে ব্যাখ্যাযোগ্য, যেমন তাঁর এই কথা: "আমরা তাকে বধ্যভূমির পথ দেখিয়েছি।"
অথবা তাঁর এই উক্তি: "হে উসমানের রক্ত সম্পর্কে জিজ্ঞাসু! উসমানের রক্ত আমার এই মস্তকেই রয়েছে; অথচ আমি তাকে হত্যার আদেশও দেইনি এবং তা থেকে নিষেধও করিনি।"
কিংবা এক দীর্ঘ বক্তব্যের মধ্যে তাঁর এই কথা: "আল্লাহর শপথ! তার মৃত্যু আমাকে আনন্দিতও করেনি, আবার ব্যথিতও করেনি।"