তাঁর কিতাব, যেমন মুসলিম তাঁর কিতাবের অধিকাংশ তাঁর (বুখারীর) কিতাব থেকে গ্রহণ করেছেন এবং এ ব্যাপারে তিনি যথাযথ যোগ্যতার পরিচয় দিয়েছেন যেহেতু তিনি তা সরাসরি তাঁর দিকে নিসবত করেননি। হাফেয আবুল হাসান আদ-দারা কুতনী বলেন: যদি বুখারী না থাকতেন, তবে মুসলিম আসতেনও না, যেতেনও না। তিনি আরও বলেন: মুসলিম মূলত বুখারীর কিতাবটি নিয়েছেন এবং সেটির ওপর ভিত্তি করে একটি মুস্তাখরাজ তৈরি করেছেন এবং তাতে কিছু হাদিস বৃদ্ধি করেছেন।

‌‌শব্দ (উচ্চারণ) সংক্রান্ত মাসআলায় তাঁর এবং যুহলীয়ের মধ্যে যা ঘটেছিল এবং এর কারণে তিনি যে পরীক্ষার সম্মুখীন হয়েছিলেন তার বিবরণ এবং তাঁর প্রতি যা আরোপ করা হয়েছিল তা থেকে তাঁর নির্দোষ হওয়ার বিবরণ
হাকেম আবু আব্দুল্লাহ তাঁর ইতিহাস গ্রন্থে বলেন: বুখারী দুইশত পঞ্চাশ হিজরিতে নিশাপুরে আগমন করেন এবং সেখানে অবস্থান করে একাধারে হাদিস বর্ণনা করতে থাকেন। তিনি বলেন: আমি মুহাম্মদ ইবনে হামিদ আল-বাযযারকে বলতে শুনেছি, তিনি বলেন: আমি হাসান ইবনে মুহাম্মদ ইবনে জাবিরকে বলতে শুনেছি, তিনি বলেন: আমি মুহাম্মদ ইবনে ইয়াহইয়া আয-যুহলীকে বলতে শুনেছি, তিনি বলতেন: তোমরা এই নেককার আলেম ব্যক্তির নিকট যাও এবং তাঁর নিকট থেকে হাদিস শ্রবণ করো। বর্ণনাকারী বলেন: ফলে মানুষ তাঁর নিকট গমন করল এবং তাঁর নিকট থেকে হাদিস শ্রবণে নিবিষ্ট হলো, এমনকি মুহাম্মদ ইবনে ইয়াহইয়ার মজলিসে লোকসংখ্যা কমে যাওয়া পরিলক্ষিত হলো। বর্ণনাকারী বলেন: এরপর তিনি (যুহলী) তাঁর সম্পর্কে বিরূপ মন্তব্য করেন। হাতেম ইবনে আহমদ ইবনে মাহমুদ বলেন: আমি মুসলিম ইবনে হাজ্জাজকে বলতে শুনেছি: মুহাম্মদ ইবনে ইসমাইল যখন নিশাপুরে আগমন করেন, তখন নিশাপুরবাসীরা তাঁর প্রতি যে সম্মান প্রদর্শন করেছিল, আমি কোনো শাসক বা আলেমের ক্ষেত্রে তেমনটি দেখিনি। তারা শহর থেকে দুই বা তিন মঞ্জিল পথ এগিয়ে গিয়ে তাঁকে অভ্যর্থনা জানিয়েছিলেন। মুহাম্মদ ইবনে ইয়াহইয়া আয-যুহলী তাঁর মজলিসে বলেছিলেন: আগামীকাল যে ব্যক্তি মুহাম্মদ ইবনে ইসমাইলকে অভ্যর্থনা জানাতে চায়, সে যেন জানায়, কেননা আমিও তাঁকে অভ্যর্থনা জানাতে যাব। ফলে মুহাম্মদ ইবনে ইয়াহইয়া এবং নিশাপুরের সাধারণ আলেমগণ তাঁকে অভ্যর্থনা জানান। অতঃপর তিনি শহরে প্রবেশ করে বুখারীদের বাড়িতে অবস্থান করেন। তখন মুহাম্মদ ইবনে ইয়াহইয়া আমাদের বলেছিলেন: তোমরা তাঁকে কালাম শাস্ত্রের কোনো বিষয়ে প্রশ্ন করো না। কারণ তিনি যদি আমাদের মতের পরিপন্থী কোনো উত্তর দেন, তবে আমাদের এবং তাঁর মাঝে বিরোধ তৈরি হবে এবং খোরাসানের প্রত্যেক নাসিবী, রাফেযী, জাহমী ও মুরজিআরা আমাদের দেখে উপহাস করবে। বর্ণনাকারী বলেন: মুহাম্মদ ইবনে ইসমাইলের কাছে মানুষের এত ভিড় হলো যে, ঘর এবং ছাদ পূর্ণ হয়ে গেল। তাঁর আগমনের দ্বিতীয় বা তৃতীয় দিনে জনৈক ব্যক্তি দাঁড়িয়ে তাঁকে কুরআনের শব্দের (উচ্চারণের) ব্যাপারে জিজ্ঞাসা করল। তিনি বললেন: আমাদের কাজসমূহ সৃষ্ট এবং আমাদের শব্দসমূহ (উচ্চারণ) আমাদের কাজেরই অন্তর্ভুক্ত। বর্ণনাকারী বলেন: ফলে মানুষের মধ্যে মতভেদ সৃষ্টি হলো। তাদের কেউ কেউ বলল: তিনি বলেছেন ‘কুরআনে আমার উচ্চারণ সৃষ্ট’। আবার কেউ কেউ বলল: তিনি তা বলেননি। এ নিয়ে তাদের মধ্যে এতই মতভেদ সৃষ্টি হলো যে, তারা একে অপরের ওপর চড়াও হওয়ার উপক্রম করল। বর্ণনাকারী বলেন: তখন বাড়ির লোকজন একত্রিত হয়ে তাদের বের করে দিল।
আবু আহমদ ইবনে আদী বলেন: একদল মাশায়েখ আমার নিকট বর্ণনা করেছেন যে, মুহাম্মদ ইবনে ইসমাইল যখন নিশাপুরে আগমন করেন এবং তাঁর নিকট মানুষের ভিড় হয়, তখন সমসাময়িক কিছু শায়খ তাঁর প্রতি ঈর্ষান্বিত হন। তাঁরা হাদিসের তালিবে ইলমদের বললেন: মুহাম্মদ ইবনে ইসমাইল বলেন ‘কুরআনে আমার উচ্চারণ সৃষ্ট’। এরপর যখন তিনি মজলিসে বসলেন, এক ব্যক্তি দাঁড়িয়ে তাঁকে বলল: হে আবু আব্দুল্লাহ, কুরআনের শব্দের (উচ্চারণের) ব্যাপারে আপনার অভিমত কী, তা কি সৃষ্ট নাকি অসৃষ্ট? বুখারী তাঁর থেকে মুখ ফিরিয়ে নিলেন এবং তিনবার কোনো উত্তর দিলেন না। লোকটি যখন পীড়াপীড়ি শুরু করল, তখন বুখারী বললেন: কুরআন আল্লাহর কালাম, তা সৃষ্ট নয়; আর বান্দার কাজসমূহ সৃষ্ট। আর (এসব বিষয়ে মানুষকে) পরীক্ষা করা বিদআত। তখন লোকটি হাঙ্গামা শুরু করল এবং বলল: তিনি বলেছেন ‘কুরআনে আমার উচ্চারণ সৃষ্ট’।
হাকেম বলেন: আবু বকর ইবনে আবুল হাইসাম আমাদের নিকট বর্ণনা করেছেন, তিনি বলেন আল-ফিরাবরী আমাদের নিকট বর্ণনা করেছেন, তিনি বলেন: আমি মুহাম্মদ ইবনে ইসমাইলকে বলতে শুনেছি: বান্দার কাজসমূহ সৃষ্ট। নিশ্চয়ই আলী ইবনে আব্দুল্লাহ আমাদের নিকট বর্ণনা করেছেন, তিনি মারওয়ান ইবনে মুয়াবিয়া থেকে, তিনি আবু মালিক থেকে, তিনি রিবঈ ইবনে হিরাশ থেকে, তিনি হুযাইফা (রা.) থেকে বর্ণনা করেন, তিনি বলেন: রাসূলুল্লাহ সাল্লাল্লাহু আলাইহি ওয়া আলিহি ওয়া সাল্লাম বলেছেন: ‘নিশ্চয়ই আল্লাহ প্রত্যেক কারিগর ও তার কারিগরিকে সৃষ্টি করেন।’ বুখারী বলেন: আমি উবাইদুল্লাহ ইবনে সাঈদ অর্থাৎ আবু কুদামা আস-সারখাসীকে বলতে শুনেছি: আমি সর্বদা আমাদের সাথীদের বলতে শুনেছি যে, বান্দার কাজসমূহ সৃষ্ট। মুহাম্মদ ইবনে ইসমাইল বলেন: তাদের নড়াচড়া, তাদের কণ্ঠস্বর, তাদের উপার্জন এবং তাদের লেখা সবকিছুই সৃষ্ট। তবে পবিত্র মাসহাফসমূহে সংরক্ষিত এবং অন্তরসমূহে রক্ষিত সুস্পষ্ট কুরআন হলো আল্লাহর কালাম, তা সৃষ্ট নয়। আল্লাহ তাআলা বলেন: {বরং যাদের জ্ঞান দান করা হয়েছে তাদের অন্তরে তা সুস্পষ্ট আয়াতসমূহ}। তিনি বলেন: ইসহাক ইবনে রাহওয়াইহ বলেছেন: পাত্রসমূহের (কণ্ঠ বা মাধ্যম) কথা যদি বলা হয়, তবে সেগুলো যে সৃষ্ট এ ব্যাপারে কার সন্দেহ আছে? আবু হামিদ ইবনুশ শারকী বলেন: আমি মুহাম্মদ ইবনে ইয়াহইয়া আয-যুহলীকে বলতে শুনেছি: কুরআন আল্লাহর কালাম, তা সৃষ্ট নয়। আর যে ব্যক্তি দাবি করে যে কুরআনে আমার উচ্চারণ সৃষ্ট, সে হলো