তাঁর সহকর্মী আহমদ কাদূরার মতো তিনিও রাজনৈতিক প্রতিহিংসার শিকার হয়েছিলেন।
কিছু আলেম লাঞ্ছনা, কারাবরণ ও নির্বাসনের শিকার হচ্ছিলেন; তা তাঁদের কোনো কৃত অপরাধের জন্য নয়, বরং যারা অপরাধ করেছে তাঁদের সাথে সংশ্লিষ্টতার কারণে। মালেকী বিচারক মুহাম্মদ বিন মালিক আলজিয়ার্স শহরের এমন একজন আলেম ছিলেন, যাঁদের ইলম এবং অসংখ্য ছাত্রের ব্যাপারে সকলে সাক্ষ্য দিতেন। তিনি নাকীবুল আশরাফের সাথেও সম্পর্কযুক্ত ছিলেন, তবে তিনি ছিলেন আলী খোজার জামাতা, যিনি মোস্তফা পাশার বিরুদ্ধে বিদ্রোহ করেছিলেন। ফলে পাশা ইবনে মালিককে আল-কোলিয়া শহরে নির্বাসিত করার এবং তাঁর পাঠদান স্থগিত করার নির্দেশ দেন। কিন্তু সৌভাগ্যক্রমে এবং রাষ্ট্রের কিছু উচ্চপদস্থ ব্যক্তির সাথে তাঁর জানাশোনা থাকা ও মাঝে মাঝে রাজনীতিতে অংশগ্রহণের সুবাদে পাশার উপদেষ্টারা তাঁর পক্ষে হস্তক্ষেপ করেন। তাঁদের যুক্তি ছিল যে, তাঁর অনেক ছাত্র রয়েছে যারা তাঁর নিকট পাঠ গ্রহণ করে এবং তিনি তাঁর জামাতার বিদ্রোহের জন্য দায়ী নন। কেবল তখনই পাশা তাঁকে তাঁর পাঠদানে ফেরার অনুমতি দেন (১)। শায়খ হামুদা আল-মাকায়িসী যখন মিসর থেকে এই ভেবে ফিরে এলেন যে, তিনি পাঠদান, জ্ঞান বিস্তার এবং সম্মানজনক জীবনযাপনের অনুকূল পরিবেশ পাবেন, তখন তিনি তা থেকে বিরত হন এবং কেবল চুড়ি (মাকায়িস) তৈরির পেশায় মনোনিবেশ করেন যাতে তা দিয়ে জীবিকা নির্বাহ করা যায়; কারণ তিনি লক্ষ্য করেন যে, কেবল যারা রাষ্ট্রীয় কর্মকর্তাদের সাথে ঘনিষ্ঠ তারাই বিশেষ সুযোগ-সুবিধা প্রাপ্ত হয় (২)। কিন্তু আমরা জানতে পেরেছি যে, এই বিশেষ সুযোগ-সুবিধা ছিল ক্ষণস্থায়ী এবং তা পাশার মেজাজ আর আলেমদের অনুগত হওয়ার সীমা ও তাঁদের ইলমি ও চারিত্রিক নীতি বিসর্জনের ওপর নির্ভরশীল ছিল। উসমানীয় যুগে নৈতিকতা রক্ষা করে একই সাথে জ্ঞানচর্চা ও চাকুরিজীবনের সমন্বয় করা ছিল অনেকটা আগুন ও পানির সমন্বয় করার মতো। আর এর অধিকারী ব্যক্তির অবস্থা ছিল বাঘের সাথে বসবাসকারীর মতো, যে জানে না কখন সে তাকে গ্রাস করবে।
আলেমদের প্রতি বে-দের আচরণ পাশাদের আচরণের চেয়ে কোনো অংশেই ভালো ছিল না। সেখানকার সম্পর্কও এখানকার মতোই ছিল—কখনো ভালো, কখনো মন্দ এবং ক্রমাগত অস্থিরতায় পূর্ণ। আমাদের কাছে এ বিষয়ে আলোচনা করে এমন বেশ কিছু উৎস রয়েছে; যেমন ইবনে মারইয়াম 'আল-বুস্তান' গ্রন্থে এবং মুহাম্মদ বিন সুলাইমান 'কাবাতুত তায়িফীন' গ্রন্থে তিলিমসানের আলেমদের অবস্থা সম্পর্কে একগুচ্ছ সংবাদ বর্ণনা করেছেন। এটি সর্বজনবিদিত যে, তাঁদের মধ্যে অনেকেই বিভিন্ন দফায় মরক্কোতে পালিয়ে গিয়েছিলেন, যার সূচনা হয়েছিল উসমানীয়দের আগমনের সময় এবং সর্বশেষটি ছিল দারকাওয়া বিদ্রোহের সময়। এবং না--------------------------------------------
(১) আজ-জাহার (আল-মুজাক্কিরাত), ৮১, ৯১।
(২) আল-হাফনাওয়ী (তারীফুল খালাফ) ২/ ১৪০।